沈阳音乐学院民族器乐系始建于1956年，是我国专业音乐院校中在民族器乐领域率先设立的科系。我国著名古筝演奏家、音乐教育家曹正，山东筝派代表音乐教育家赵玉斋，东北扬琴学派代表音乐教育家宿英，川派古琴代表音乐教育家顾梅羹，著名二胡演奏家、音乐教育家朱郁之、唐毓斌等一批享誉海内外的民族器乐教育家与演奏大师曾在此任教，并培养出多位引领专业学科前沿的学术带头人、专家学者和音乐才俊。历任系主任包括朱郁之、唐毓斌、果俊明、关文举、刘刚、赵夺良、魏国。现任系主任张科威、党总支书记常亮、副书记温雅、副主任张明。
秉承毛泽东亲笔题写的“紧张、严肃、刻苦、虚心”的校训，民族器乐系始终致力于“高水平、有特色、国际化”的一流音乐院校办学目标，锐意进取，传承创新。现已构建起集教学、科研、艺术实践与文化传承推广于一体的教育体系。我系坚持立德树人，聚焦提升教学质量，在学科建设、师资优化、课程设置、人才培养及教学管理等方面均展现出独特优势与风格。部分专业在国内处于领先地位，其中，民族器乐演奏所属的音乐表演专业获批国家级一流本科专业建设点，音乐表演（中国乐器演奏）是省级特色专业、省级优势特色专业。
民族器乐系设有拉弦、弹拨、管乐与打击乐、室内乐与创编、艺术指导五个教研室，覆盖二胡、板胡、琵琶、古筝、箜篌、柳琴、中阮、扬琴、古琴、大提琴、竹笛、唢呐、笙、管子、民族打击乐、低音提琴16个专业方向。教师队伍荣获多项国家级与省级荣誉，包括教育部“全国优秀教育奖”、文化部“区永熙优秀音乐教育奖”、国务院政府特殊津贴专家称号及辽宁省“四个一批”人才等。
近年来，系内师生在“文华奖”“金钟奖”及CCTV大赛等国家级和省级赛事中屡获殊荣，累计获奖超过500人次，为民族器乐艺术的薪火相传与发展注入了不竭动力。
民族器乐系拥有一支规模宏大、建制完善的北方民族乐团，影响力辐射全国。乐团成功举办了《华彩金秋——大型民族管弦乐音乐会》《辽宁省第五届艺术节专场音乐会》《第二十七届“哈尔滨之夏”专场音乐会》《沈阳国际交流展音乐会》《沈阳·新春音乐会》《“一带一路”大型民族交响音乐会》《百年华诞》等百余场大型艺术实践活动，其以精湛的技艺和深厚的文化底蕴，为弘扬民族文化、增强文化自信贡献了卓越力量。