沈阳音乐学院音乐教育系在原沈阳音乐学院音乐专科的基础上于1965年建系，“文革”中停办。1982年，经辽宁省人民政府批准恢复建系，是目前我国高等音乐艺术院校中建系较早的科系。本专业培养学生德、智、体、美全面发展，培养能在各级各类院校从事音乐教学、研究和管理的复合型人才。
音乐教育系现设有声乐、钢琴、作曲技术理论、音乐基础理论与教育理论、钢琴伴奏教学5个教研室及音乐教育信息研究中心。拥有一支优秀的教师队伍，全系目前有教职员工62人，专任教师56人，其中教授16人，副教授24人，行政管理人员2人，辅导员4人；在校本科生及研究生人797人。
作为学院的重点专业之一，音乐教育系经过50余年的建设与发展，现已形成了以素质教育为基础、以能力培养为中心、教学科研与艺术实践相结合，富有时代特征、符合我国高等教育教学质量标准的人才培养体系。在2014年辽宁省普通高等学校本科专业综合评价中，我系位列音乐学（音乐教育）专业排名第一，2015年被评为辽宁省本科优势特色专业。
音乐教育系紧密围绕培养目标，关注音乐教育改革动态和走向，对课程设置及构建、教学内容及方法等方面进行了改革与探索。先后完成了音乐教育专业的主干课程和专业基础课程教学大纲及20余部教材的编写工作。其中有1部教材获国家教育部中青年奖，2部教材获辽宁省优秀教学成果二等奖，1部教材获辽宁省教学成果三等奖，有15部教材被评为学院的优秀教材。
恢复建系以来，音乐教育系共参与和完成国家教育科学研究9项，省级科研27项；共出版专（编）著和教材100余部，在省级以上刊物发表学术论文550余篇； 1门课程被评为省级精品课程，1门课程被评为省级精品视频公开课程，2门课程被评为学院精品课程；获辽宁省高校教学名师称号2人；一个教研室被评为省级优秀教学团队；教师中有多人（次）获国家级、省部级科研成果奖；师生中有多人（次）在教育部、辽宁省主办的音乐教育专业比赛中获得优异成绩。
50多年来，音乐教育系培养了大批优秀的毕业生，他们分布在全国各大、中、小、幼等教育战线上，仅辽宁省的中学音乐教师中就有近50％出自音乐教育系，辽宁省的省、市、区（县）的音乐教研员中绝大部分也出自音乐教育系。毕业生中有数十人（次）在全国、省、市举办的各类比赛中获奖。
音乐教育系注重开展学术交流，我系教师先后到美国和欧洲进行讲学和考察活动；另有美国、法国、英国、德国、日本、意大利、西班牙、瑞典、希腊、澳大利亚、新加坡、加拿大、巴西及国内的专家学者来我系讲学、考察、举办音乐会等，如：美国西北大学的雷默教授、法国国立音乐学院的布菲教授、教育部艺术教育委员会副主任周荫昌教授、福建师范大学王耀华教授、首都师范大学王安国教授、中央音乐学院的俞人豪教授、中国社会科学院的腾守尧研究员等。2010年，我系承办了“第29届世界音乐教育大会——学校音乐与教师教育专题会议”，2011年承办了“金嗓子”第二届全国高校音乐学（教师教育）声乐专业教师与研究生演唱邀请赛。这些学术交流活动，加强了音乐教育系的学术气氛，提升了沈阳音乐学院的对外影响力。
当前，音乐教育系正在为实现学院党委所提出的创建“高水平、有特色、国际化教学研究型音乐名校”的目标而努力奋斗。